MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 chromosome

Total Repeats: 39388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017735	CTT	2	6	35	40	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747037
2	NC_017735	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	386747037
3	NC_017735	AC	3	6	268	273	50 %	0 %	0 %	50 %	386747037
4	NC_017735	ATT	2	6	305	310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747037
5	NC_017735	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	386747037
6	NC_017735	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	386747037
7	NC_017735	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747037
8	NC_017735	AAT	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747037
9	NC_017735	TAG	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747038
10	NC_017735	C	8	8	642	649	0 %	0 %	0 %	100 %	386747038
11	NC_017735	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
12	NC_017735	AC	4	8	667	674	50 %	0 %	0 %	50 %	386747038
13	NC_017735	CAT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747038
14	NC_017735	T	6	6	684	689	0 %	100 %	0 %	0 %	386747038
15	NC_017735	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	386747038
16	NC_017735	AAT	2	6	697	702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
17	NC_017735	AAT	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
18	NC_017735	CAAT	2	8	787	794	50 %	25 %	0 %	25 %	386747038
19	NC_017735	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747038
20	NC_017735	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386747038
21	NC_017735	ATA	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
22	NC_017735	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386747039
23	NC_017735	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747039
24	NC_017735	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747039
25	NC_017735	GCAGCT	2	12	1045	1056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386747039
26	NC_017735	ATT	2	6	1165	1170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747039
27	NC_017735	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	386747039
28	NC_017735	CA	3	6	1234	1239	50 %	0 %	0 %	50 %	386747039
29	NC_017735	TTA	2	6	1240	1245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747039
30	NC_017735	TAC	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747039
31	NC_017735	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	386747039
32	NC_017735	TGA	2	6	1358	1363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747039
33	NC_017735	GTTT	2	8	1368	1375	0 %	75 %	25 %	0 %	386747039
34	NC_017735	CACT	2	8	1454	1461	25 %	25 %	0 %	50 %	386747039
35	NC_017735	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386747039
36	NC_017735	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747039
37	NC_017735	TCA	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747039
38	NC_017735	TCTTT	2	10	1743	1752	0 %	80 %	0 %	20 %	386747040
39	NC_017735	GCCA	2	8	1819	1826	25 %	0 %	25 %	50 %	386747040
40	NC_017735	ATT	2	6	1841	1846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747040
41	NC_017735	CT	4	8	1852	1859	0 %	50 %	0 %	50 %	386747040
42	NC_017735	TTC	2	6	1970	1975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747040
43	NC_017735	T	6	6	2032	2037	0 %	100 %	0 %	0 %	386747040
44	NC_017735	CAT	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747040
45	NC_017735	ATG	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747040
46	NC_017735	TGG	2	6	2180	2185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747040
47	NC_017735	ACT	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747040
48	NC_017735	CA	3	6	2267	2272	50 %	0 %	0 %	50 %	386747040
49	NC_017735	TTA	2	6	2411	2416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017735	TTTGT	2	10	2420	2429	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017735	AGA	2	6	2536	2541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747041
52	NC_017735	A	8	8	2541	2548	100 %	0 %	0 %	0 %	386747041
53	NC_017735	GTTT	2	8	2629	2636	0 %	75 %	25 %	0 %	386747041
54	NC_017735	T	7	7	2634	2640	0 %	100 %	0 %	0 %	386747041
55	NC_017735	TGA	2	6	2659	2664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747041
56	NC_017735	T	7	7	2676	2682	0 %	100 %	0 %	0 %	386747041
57	NC_017735	CATT	2	8	2764	2771	25 %	50 %	0 %	25 %	386747041
58	NC_017735	AGT	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747041
59	NC_017735	A	6	6	2825	2830	100 %	0 %	0 %	0 %	386747041
60	NC_017735	GT	3	6	2889	2894	0 %	50 %	50 %	0 %	386747041
61	NC_017735	AAAG	2	8	2942	2949	75 %	0 %	25 %	0 %	386747041
62	NC_017735	GTG	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747041
63	NC_017735	AG	3	6	2998	3003	50 %	0 %	50 %	0 %	386747041
64	NC_017735	AGA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747041
65	NC_017735	TGG	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747041
66	NC_017735	AAAG	2	8	3245	3252	75 %	0 %	25 %	0 %	386747042
67	NC_017735	AG	3	6	3307	3312	50 %	0 %	50 %	0 %	386747042
68	NC_017735	GAAA	2	8	3319	3326	75 %	0 %	25 %	0 %	386747042
69	NC_017735	CA	3	6	3361	3366	50 %	0 %	0 %	50 %	386747042
70	NC_017735	TG	3	6	3426	3431	0 %	50 %	50 %	0 %	386747042
71	NC_017735	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747042
72	NC_017735	TGA	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747042
73	NC_017735	CTA	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747042
74	NC_017735	GAAA	2	8	3785	3792	75 %	0 %	25 %	0 %	386747042
75	NC_017735	CAAG	2	8	3829	3836	50 %	0 %	25 %	25 %	386747042
76	NC_017735	ATT	2	6	3912	3917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747042
77	NC_017735	TAG	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747042
78	NC_017735	TTG	2	6	4051	4056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017735	GTTT	2	8	4064	4071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017735	GGT	2	6	4115	4120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017735	AAAC	2	8	4164	4171	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017735	TGG	2	6	4205	4210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017735	AAT	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017735	TGG	2	6	4337	4342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017735	CA	3	6	4412	4417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017735	GTG	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017735	ACC	2	6	4489	4494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017735	GGT	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017735	ACAA	2	8	4637	4644	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017735	A	6	6	4663	4668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017735	ATA	2	6	4678	4683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017735	T	8	8	4687	4694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017735	T	6	6	4729	4734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017735	A	6	6	4743	4748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017735	TCA	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017735	GAA	2	6	4822	4827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017735	ATGA	2	8	4831	4838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017735	TTTG	2	8	4852	4859	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017735	TAA	2	6	4903	4908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017735	TGT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017735	ATT	2	6	5001	5006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017735	TGTA	2	8	5078	5085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017735	TC	4	8	5100	5107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017735	T	6	6	5155	5160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017735	CAT	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
106	NC_017735	CTG	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386747043
107	NC_017735	TCT	2	6	5275	5280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
108	NC_017735	TGAAAC	2	12	5322	5333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386747043
109	NC_017735	TTCT	2	8	5351	5358	0 %	75 %	0 %	25 %	386747043
110	NC_017735	CTT	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
111	NC_017735	TTGC	2	8	5410	5417	0 %	50 %	25 %	25 %	386747043
112	NC_017735	TTCA	2	8	5451	5458	25 %	50 %	0 %	25 %	386747043
113	NC_017735	CGC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386747043
114	NC_017735	AGC	2	6	5487	5492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386747043
115	NC_017735	CGCA	2	8	5517	5524	25 %	0 %	25 %	50 %	386747043
116	NC_017735	TAA	2	6	5525	5530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747043
117	NC_017735	TCA	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
118	NC_017735	TGC	2	6	5595	5600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386747043
119	NC_017735	ACC	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386747043
120	NC_017735	CTT	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
121	NC_017735	TCTT	2	8	5668	5675	0 %	75 %	0 %	25 %	386747043
122	NC_017735	AGC	2	6	5697	5702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386747043
123	NC_017735	AG	3	6	5730	5735	50 %	0 %	50 %	0 %	386747043
124	NC_017735	TCTT	2	8	5745	5752	0 %	75 %	0 %	25 %	386747043
125	NC_017735	TTG	2	6	5777	5782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747043
126	NC_017735	TCA	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
127	NC_017735	GTG	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747043
128	NC_017735	TTC	2	6	5882	5887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
129	NC_017735	TTC	2	6	5937	5942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
130	NC_017735	ACC	2	6	5955	5960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386747043
131	NC_017735	TTTCT	2	10	5987	5996	0 %	80 %	0 %	20 %	386747043
132	NC_017735	TTTA	2	8	6051	6058	25 %	75 %	0 %	0 %	386747043
133	NC_017735	GAT	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747043
134	NC_017735	GAA	2	6	6146	6151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747043
135	NC_017735	GA	3	6	6247	6252	50 %	0 %	50 %	0 %	386747043
136	NC_017735	CTT	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
137	NC_017735	TCT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
138	NC_017735	T	6	6	6438	6443	0 %	100 %	0 %	0 %	386747043
139	NC_017735	T	6	6	6450	6455	0 %	100 %	0 %	0 %	386747043
140	NC_017735	CTTCA	2	10	6498	6507	20 %	40 %	0 %	40 %	386747043
141	NC_017735	CAG	2	6	6521	6526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386747043
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